Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35F4A4IF30 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35F4A4IF30 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms