Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMCO3A2RU48 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO3A2RU48 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMCO3A2RU48 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMCO3A2RU48 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMCO3A2RU48 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms