Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms