Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 U2SURP-212ENST00000488587 866 ntTSL 31.43□□□□□ -2.183e-6■■■■□ 20.2
RBM22Q9NW64 IARS-209ENST00000473915 610 ntTSL 31.2□□□□□ -2.221e-8■■■■□ 20.2
RBM22Q9NW64 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.224e-6■■■■□ 20.2
RBM22Q9NW64 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.554e-6■■■■□ 20.2
RBM22Q9NW64 DDIT4-202ENST00000471240 521 ntTSL 221.53■■□□□ 1.047e-8■■■■□ 20.2
RBM22Q9NW64 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.027e-8■■■■□ 20.2
RBM22Q9NW64 DDIT4-203ENST00000473155 753 ntTSL 1 (best)20.6■□□□□ 0.897e-8■■■■□ 20.2
RBM22Q9NW64 OGT-203ENST00000444774 556 ntTSL 411.33□□□□□ -0.67e-7■■■■□ 20.2
RBM22Q9NW64 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.692e-7■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.452e-12■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.591e-8■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 RPL27A-203ENST00000525981 297 ntTSL 514.53□□□□□ -0.081e-8■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.081e-8■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 RPL27A-212ENST00000534599 651 ntTSL 513.21□□□□□ -0.291e-8■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.481e-8■■■■□ 20.1
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RBM22Q9NW64 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.341e-8■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 SLC30A9-205ENST00000513699 2217 ntTSL 213.45□□□□□ -0.266e-6■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 SLC30A9-201ENST00000264451 6218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.756e-6■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.514e-6■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 ACSF3-213ENST00000542688 2024 ntTSL 516.77■□□□□ 0.284e-6■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.274e-6■■■■□ 20.1
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RBM22Q9NW64 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.364e-6■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 TMC6-219ENST00000591594 614 ntTSL 316.91■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 IGF2BP2-208ENST00000466476 469 ntTSL 212.2□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.842e-6■■■■□ 20.1
RBM22Q9NW64 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.011e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.711e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 DNAJB1-211ENST00000601533 573 ntTSL 218.43■□□□□ 0.541e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 SHMT2-206ENST00000553529 562 ntTSL 418.26■□□□□ 0.511e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 TIMM44-205ENST00000597926 819 ntTSL 317.58■□□□□ 0.48e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.361e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 DNAJB1-203ENST00000594099 995 ntTSL 417.25■□□□□ 0.351e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 DNAJB1-207ENST00000596853 593 ntTSL 416.8■□□□□ 0.281e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.261e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.241e-9■■■■□ 20
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RBM22Q9NW64 DTYMK-202ENST00000400770 1089 ntTSL 1 (best)15.77■□□□□ 0.121e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.071e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 SHMT2-204ENST00000553324 566 ntTSL 415.45■□□□□ 0.061e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 SRRT-214ENST00000614370 556 ntTSL 215.28■□□□□ 0.041e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 DNAJB1-206ENST00000596075 573 ntTSL 415.2■□□□□ 0.021e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.011e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 SHMT2-210ENST00000553950 584 ntTSL 214.76□□□□□ -0.051e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 SHMT2-208ENST00000553868 941 ntTSL 214.65□□□□□ -0.061e-9■■■■□ 20
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RBM22Q9NW64 WDR74-215ENST00000544831 814 ntTSL 214.23□□□□□ -0.131e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 B3GNTL1-209ENST00000573363 471 ntTSL 214.01□□□□□ -0.171e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 SHMT2-234ENST00000557703 542 ntTSL 413.86□□□□□ -0.191e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-9■■■■□ 20
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RBM22Q9NW64 DNAJB1-209ENST00000598692 567 ntTSL 212.8□□□□□ -0.361e-9■■■■□ 20
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RBM22Q9NW64 SHMT2-216ENST00000554975 780 ntTSL 311.01□□□□□ -0.651e-9■■■■□ 20
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RBM22Q9NW64 SHMT2-213ENST00000554600 837 ntTSL 210.73□□□□□ -0.691e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 SHMT2-215ENST00000554656 817 ntTSL 310.47□□□□□ -0.731e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 SHMT2-224ENST00000556737 572 ntTSL 210.34□□□□□ -0.751e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 DTYMK-206ENST00000464603 890 ntTSL 28.88□□□□□ -0.991e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 DNAJB1-202ENST00000396969 1287 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.071e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 CTTN-207ENST00000483662 736 ntTSL 26.69□□□□□ -1.341e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 DTYMK-204ENST00000432348 926 ntTSL 56.25□□□□□ -1.411e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 DNAJB1-205ENST00000595992 601 ntTSL 25.28□□□□□ -1.561e-9■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 WRN-203ENST00000521620 3593 ntTSL 1 (best)3.59□□□□□ -1.834e-7■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.126e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.36e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.066e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 IFNGR2-206ENST00000545369 966 ntTSL 518.36■□□□□ 0.536e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 IFNGR2-204ENST00000421802 727 ntTSL 312.53□□□□□ -0.46e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 PSMD12-205ENST00000579365 560 ntTSL 420.34■□□□□ 0.852e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 PSMD12-207ENST00000584008 1752 ntTSL 1 (best)18.83■□□□□ 0.612e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 PSMD12-208ENST00000584289 1090 ntTSL 1 (best)18.49■□□□□ 0.552e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 PSMD12-206ENST00000581618 613 ntTSL 418.36■□□□□ 0.532e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.382e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 PSMD12-204ENST00000578015 448 ntTSL 216.34■□□□□ 0.212e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 SLC43A1-202ENST00000524995 953 ntTSL 319.89■□□□□ 0.773e-7■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 SLC43A1-207ENST00000533066 999 ntTSL 318.03■□□□□ 0.483e-7■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 SLC43A1-210ENST00000534105 580 ntTSL 517.75■□□□□ 0.433e-7■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 SLC43A1-206ENST00000530159 788 ntTSL 516.49■□□□□ 0.233e-7■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.036e-8■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 TDG-208ENST00000544060 1139 ntTSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.63e-10■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 TDG-210ENST00000545698 862 ntTSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.63e-10■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.133e-10■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 TDG-203ENST00000436021 824 ntTSL 515.67■□□□□ 0.13e-10■■■■□ 20
RBM22Q9NW64 TDG-205ENST00000537100 923 ntTSL 315.62■□□□□ 0.093e-10■■■■□ 20
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