Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.568e-7■■■■■ 170.3
UTP3Q9NQZ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.448e-7■■■■■ 170.2
UTP3Q9NQZ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.068e-7■■■■■ 170.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-226ENST00000543756 613 ntTSL 318.42■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 170.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-218ENST00000542129 1561 ntTSL 218.1■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 170.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-205ENST00000438391 1135 ntTSL 516.08■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 170.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-217ENST00000540935 1210 ntTSL 215.65■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 170.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-206ENST00000535158 1718 ntTSL 215.4■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 170.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-203ENST00000415475 883 ntTSL 312.91□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 170.2
UTP3Q9NQZ2 LARP1-203ENST00000518194 450 ntTSL 512.31□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 LARP1-213ENST00000523163 843 ntTSL 58.49□□□□□ -1.052e-9■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 STAT5A-202ENST00000444283 515 ntTSL 425.39■■□□□ 1.662e-10■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 STAT5A-210ENST00000590726 835 ntTSL 324.65■■□□□ 1.542e-10■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.644e-8■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.592e-10■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.552e-10■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.252e-10■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-208ENST00000437877 864 ntTSL 216.41■□□□□ 0.222e-10■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 ACVR2B-202ENST00000461232 5370 ntTSL 1 (best)15.91■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.14e-8■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.124e-8■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-10■■■■■ 170.1
UTP3Q9NQZ2 RNF216-209ENST00000484458 492 ntTSL 58.69□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 170
UTP3Q9NQZ2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 170
UTP3Q9NQZ2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 170
UTP3Q9NQZ2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 170
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-215ENST00000534460 427 ntTSL 38.28□□□□□ -1.089e-8■■■■■ 170
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-209ENST00000528066 569 ntTSL 37.34□□□□□ -1.239e-8■■■■■ 170
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-213ENST00000529763 720 ntTSL 56.83□□□□□ -1.329e-8■■■■■ 170
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-207ENST00000486666 4086 ntTSL 24.86□□□□□ -1.639e-8■■■■■ 170
UTP3Q9NQZ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.964e-7■■■■■ 170
UTP3Q9NQZ2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.055e-9■■■■■ 169.9
UTP3Q9NQZ2 EMC1-206ENST00000475079 557 ntTSL 411.1□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 169.9
UTP3Q9NQZ2 EMC1-211ENST00000488681 562 ntTSL 310.7□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 169.9
UTP3Q9NQZ2 USP36-210ENST00000588086 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 169.9
UTP3Q9NQZ2 UROS-205ENST00000420761 802 ntTSL 527.23■■□□□ 1.954e-9■■■■■ 169.8
UTP3Q9NQZ2 PHF12-213ENST00000583747 648 ntTSL 321.99■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 169.8
UTP3Q9NQZ2 PHF12-211ENST00000582853 555 ntTSL 421.04■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 169.8
UTP3Q9NQZ2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.784e-9■■■■■ 169.8
UTP3Q9NQZ2 PHF12-214ENST00000584236 555 ntTSL 411.12□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 169.8
UTP3Q9NQZ2 UROS-206ENST00000462490 3188 ntTSL 510.41□□□□□ -0.744e-9■■■■■ 169.8
UTP3Q9NQZ2 PHF12-209ENST00000582436 5697 ntTSL 510.15□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 169.8
UTP3Q9NQZ2 PHF12-204ENST00000483934 751 ntTSL 58.5□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 169.8
UTP3Q9NQZ2 FDXR-215ENST00000581969 568 ntTSL 421.49■■□□□ 1.035e-7■■■■■ 169.7
UTP3Q9NQZ2 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.49e-7■■■■■ 169.6
UTP3Q9NQZ2 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.599e-7■■■■■ 169.6
UTP3Q9NQZ2 GPR78-206ENST00000513120 3720 ntTSL 212.65□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MYBBP1A-205ENST00000571368 1995 ntTSL 219.88■□□□□ 0.775e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-220ENST00000483165 603 ntTSL 419.21■□□□□ 0.675e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MYBBP1A-211ENST00000574547 1607 ntTSL 1 (best)18.96■□□□□ 0.635e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MYBBP1A-206ENST00000572759 588 ntTSL 317.18■□□□□ 0.345e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MYBBP1A-212ENST00000574934 1941 ntTSL 215.61■□□□□ 0.095e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 POR-215ENST00000453773 498 ntTSL 414.65□□□□□ -0.065e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 POR-211ENST00000439963 625 ntTSL 414.47□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MYBBP1A-210ENST00000574167 746 ntTSL 314.3□□□□□ -0.125e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-213ENST00000464344 3993 ntTSL 313.98□□□□□ -0.175e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 ATXN7L1-209ENST00000481880 870 ntTSL 212.98□□□□□ -0.335e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-211ENST00000455202 2626 ntTSL 212.66□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-202ENST00000391980 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.555e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-219ENST00000493169 576 ntTSL 411.29□□□□□ -0.65e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MTCL1-207ENST00000518815 3963 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.635e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-215ENST00000476564 614 ntTSL 211.01□□□□□ -0.655e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-201ENST00000241527 4529 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.675e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-217ENST00000480298 585 ntTSL 410.5□□□□□ -0.735e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 ATXN7L1-201ENST00000318724 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 ATXN7L1-208ENST00000478915 1115 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.885e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-203ENST00000401626 561 ntTSL 58.17□□□□□ -1.15e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MIR3681HG-204ENST00000438292 442 ntTSL 37.95□□□□□ -1.145e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.245e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.384e-10■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.68e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.398e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.38e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.258e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.218e-8■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.936e-7■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 169.5
UTP3Q9NQZ2 FBXW11-207ENST00000519693 758 ntTSL 227.76■■■□□ 2.031e-7■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 FBXW11-208ENST00000520376 686 ntTSL 225.84■■□□□ 1.731e-7■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 FBXW11-212ENST00000523843 2099 ntTSL 523.22■■□□□ 1.311e-7■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.814e-7■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 PHB2-210ENST00000544888 872 ntTSL 320.46■□□□□ 0.872e-12■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 PHB2-211ENST00000545167 908 ntTSL 519.4■□□□□ 0.72e-12■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 SIK3-204ENST00000445177 6331 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.1■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 169.3
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.97e-19■■■■■ 169.2
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.887e-19■■■■■ 169.2
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1115.8 ms