Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2AFJQ9BTM1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms