Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PRAC1Q96KF2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms