Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3AQ92484 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms