Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms