Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN1Q14457 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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