Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SRSF11-215ENST00000486667 662 ntTSL 59.44□□□□□ -0.92e-6■■■□□ 17.6
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TARDBPQ13148 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-9■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.482e-9■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 AGAP3-203ENST00000461065 1707 ntTSL 1 (best)14.83□□□□□ -0.042e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 AGAP3-212ENST00000473633 3751 ntTSL 1 (best)9.12□□□□□ -0.952e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.245e-7■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.125e-7■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 213.87□□□□□ -0.195e-7■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.225e-7■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.199e-7■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 RERE-210ENST00000468247 414 ntTSL 221.17■□□□□ 0.981e-6■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 COASY-213ENST00000591753 2225 ntTSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.23e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.273e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 COASY-212ENST00000591583 716 ntTSL 213.07□□□□□ -0.323e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.363e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.581e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.29□□□□□ -1.721e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 SND1-208ENST00000470463 530 ntTSL 410.17□□□□□ -0.783e-7■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-217ENST00000489072 1014 ntTSL 325.04■■□□□ 1.69e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-207ENST00000436324 1045 ntTSL 218.35■□□□□ 0.539e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.519e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-210ENST00000464078 508 ntTSL 517.86■□□□□ 0.459e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.49e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-206ENST00000431390 1552 ntTSL 316.94■□□□□ 0.39e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-208ENST00000443046 823 ntTSL 315.04■□□□□ -09e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-216ENST00000486741 4299 ntTSL 212.74□□□□□ -0.379e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-213ENST00000482192 793 ntTSL 311.86□□□□□ -0.519e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-220ENST00000492280 2707 ntTSL 511.77□□□□□ -0.539e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-215ENST00000485550 745 ntTSL 510.93□□□□□ -0.669e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-202ENST00000380747 709 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.959e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-201ENST00000288344 1303 ntTSL 29.04□□□□□ -0.969e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-205ENST00000419378 850 ntTSL 26.85□□□□□ -1.319e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 HMGN1-218ENST00000490032 405 ntTSL 35.16□□□□□ -1.589e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 PICALM-213ENST00000530542 905 ntTSL 56.08□□□□□ -1.441e-6■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 SMPD4P1-203ENST00000443839 2108 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -14e-6■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 MAP4-212ENST00000468075 487 ntTSL 515.5■□□□□ 0.072e-6■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 17.5
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TARDBPQ13148 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-6■■■□□ 17.5
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TARDBPQ13148 NUP85-211ENST00000579324 2010 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.771e-7■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 NUP85-210ENST00000579298 1890 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.851e-7■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 NUP85-208ENST00000578830 922 ntTSL 59.09□□□□□ -0.951e-7■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 NUP85-216ENST00000581104 2233 ntTSL 29.07□□□□□ -0.961e-7■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.475e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.75e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.335e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.285e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.155e-9■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.134e-6■■■□□ 17.5
TARDBPQ13148 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.294e-6■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.373e-9■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.473e-9■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 RFWD3-210ENST00000575281 494 ntTSL 44.8□□□□□ -1.643e-9■■■□□ 17.4
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TARDBPQ13148 ARID1B-231ENST00000637887 1468 ntTSL 56.28□□□□□ -1.41e-6■■■□□ 17.4
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TARDBPQ13148 ATF2-207ENST00000409833 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.777e-16■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 ATF2-216ENST00000435231 784 ntTSL 59.92□□□□□ -0.827e-16■■■□□ 17.4
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TARDBPQ13148 ATF2-206ENST00000409635 2109 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -17e-16■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 ATF2-209ENST00000415955 1896 ntTSL 1 (best)8.26□□□□□ -1.097e-16■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.217e-16■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 ATF2-213ENST00000428760 1989 ntTSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.227e-16■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 ATF2-211ENST00000421438 1966 ntTSL 1 (best)7.33□□□□□ -1.247e-16■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 ATF2-215ENST00000435004 1115 ntTSL 57.09□□□□□ -1.277e-16■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 ATF2-214ENST00000429579 2081 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.287e-16■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 ATF2-217ENST00000437522 883 ntTSL 56.87□□□□□ -1.317e-16■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.357e-16■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 NUP214-224ENST00000530863 560 ntTSL 54.68□□□□□ -1.669e-10■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MED15-210ENST00000432052 598 ntTSL 420.86■□□□□ 0.932e-9■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MED15-225ENST00000477824 571 ntTSL 520.78■□□□□ 0.922e-9■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MED15-215ENST00000444094 551 ntTSL 419.64■□□□□ 0.732e-9■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MED15-205ENST00000414658 717 ntTSL 318.55■□□□□ 0.562e-9■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MED15-227ENST00000486656 577 ntTSL 418.55■□□□□ 0.562e-9■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MED15-214ENST00000441501 840 ntTSL 317.02■□□□□ 0.322e-9■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MED15-217ENST00000445987 590 ntTSL 416.2■□□□□ 0.182e-9■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MED15-213ENST00000438962 573 ntTSL 414.38□□□□□ -0.112e-9■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MBNL1-215ENST00000477171 1039 ntTSL 36.36□□□□□ -1.391e-6■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 SRSF11-209ENST00000463877 617 ntTSL 228.36■■■□□ 2.131e-6■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.031e-6■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.321e-6■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 XPO1-211ENST00000451765 643 ntTSL 316.65■□□□□ 0.261e-9■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.767e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.157e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.217e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.327e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.77e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 HNRNPH3-204ENST00000467249 566 ntTSL 27.41□□□□□ -1.222e-13■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 EIF4G1-224ENST00000444861 2384 ntTSL 1 (best)21.59■■□□□ 1.051e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.655e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.165e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.425e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 ZFPM2-209ENST00000522296 3312 ntTSL 25.16□□□□□ -1.583e-7■■■□□ 17.4
TARDBPQ13148 ATAD1-201ENST00000308448 4640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-7■■■□□ 17.4
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