RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468247.1

RERE-210, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 2

Gene RERE, Length 414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-210ENST00000468247 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.07■■■■■ 5.93
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RERE-210ENST00000468247 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.06■■■■■ 4.64
RERE-210ENST00000468247 NACADO15069 1562 aa43.86■■■■■ 4.61
RERE-210ENST00000468247 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.78■■■■■ 4.6
RERE-210ENST00000468247 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.38■■■■■ 4.54
RERE-210ENST00000468247 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
RERE-210ENST00000468247 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.11■■■■■ 4.49
RERE-210ENST00000468247 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.11■■■■■ 4.49
RERE-210ENST00000468247 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.05■■■■■ 4.48
RERE-210ENST00000468247 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.99■■■■■ 4.47
RERE-210ENST00000468247 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.86■■■■■ 4.45
RERE-210ENST00000468247 SCRIBQ14160 1630 aa42.46■■■■■ 4.39
RERE-210ENST00000468247 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.2■■■■■ 4.35
RERE-210ENST00000468247 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
RERE-210ENST00000468247 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.72■■■■■ 4.27
RERE-210ENST00000468247 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.54■■■■■ 4.24
RERE-210ENST00000468247 SMARCA4P51532 1647 aa40.53■■■■■ 4.08
RERE-210ENST00000468247 NCAPD3P42695 1498 aa40.52■■■■■ 4.08
RERE-210ENST00000468247 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.48■■■■■ 4.07
RERE-210ENST00000468247 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
RERE-210ENST00000468247 SMARCA2P51531 1590 aa40.33■■■■■ 4.05
RERE-210ENST00000468247 HMGXB3Q12766 1538 aa40.24■■■■■ 4.03
RERE-210ENST00000468247 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.17■■■■■ 4.02
RERE-210ENST00000468247 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.11■■■■■ 4.01
RERE-210ENST00000468247 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
RERE-210ENST00000468247 NESP48681 1621 aa39.83■■■■□ 3.97
RERE-210ENST00000468247 ERCC6Q03468 1493 aa39.8■■■■□ 3.96
RERE-210ENST00000468247 WIZO95785 1651 aa39.69■■■■□ 3.94
RERE-210ENST00000468247 CUX2O14529 1486 aa39.57■■■■□ 3.93
RERE-210ENST00000468247 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.51■■■■□ 3.92
RERE-210ENST00000468247 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
RERE-210ENST00000468247 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.33■■■■□ 3.89
RERE-210ENST00000468247 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
RERE-210ENST00000468247 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.27■■■■□ 3.88
RERE-210ENST00000468247 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.27■■■■□ 3.88
RERE-210ENST00000468247 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
RERE-210ENST00000468247 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.14■■■■□ 3.86
RERE-210ENST00000468247 CFTRP13569 1480 aa38.96■■■■□ 3.83
RERE-210ENST00000468247 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.94■■■■□ 3.82
RERE-210ENST00000468247 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.87■■■■□ 3.81
RERE-210ENST00000468247 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.85■■■■□ 3.81
RERE-210ENST00000468247 WDR62O43379 1518 aa38.84■■■■□ 3.81
RERE-210ENST00000468247 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.77■■■■□ 3.8
RERE-210ENST00000468247 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
RERE-210ENST00000468247 PRDM2Q13029 1718 aa38.53■■■■□ 3.76
RERE-210ENST00000468247 TOPBP1Q92547 1522 aa38.19■■■■□ 3.7
RERE-210ENST00000468247 IFT140Q96RY7 1462 aa38.07■■■■□ 3.68
RERE-210ENST00000468247 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.06■■■■□ 3.68
RERE-210ENST00000468247 ABCC8Q09428 1581 aa38.05■■■■□ 3.68
RERE-210ENST00000468247 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
RERE-210ENST00000468247 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
RERE-210ENST00000468247 OSCARQ8IYS5 282 aa37.85■■■■□ 3.65
RERE-210ENST00000468247 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
RERE-210ENST00000468247 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
RERE-210ENST00000468247 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
RERE-210ENST00000468247 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.73■■■■□ 3.631e-8■■■■■ 34.1
RERE-210ENST00000468247 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.72■■■■□ 3.63
RERE-210ENST00000468247 CUX1P39880 1505 aa37.71■■■■□ 3.63
RERE-210ENST00000468247 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.65■■■■□ 3.62
RERE-210ENST00000468247 SOGA1O94964 1423 aa37.65■■■■□ 3.62
RERE-210ENST00000468247 TRIM41Q8WV44 630 aa37.61■■■■□ 3.61
RERE-210ENST00000468247 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
RERE-210ENST00000468247 CHD1O14646 1710 aa37.43■■■■□ 3.58
RERE-210ENST00000468247 WDR97A6NE52 1622 aa37.38■■■■□ 3.57
RERE-210ENST00000468247 FBLN2P98095 1184 aa37.36■■■■□ 3.57
RERE-210ENST00000468247 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.35■■■■□ 3.57
RERE-210ENST00000468247 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.35■■■■□ 3.57
RERE-210ENST00000468247 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.35■■■■□ 3.57
RERE-210ENST00000468247 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.34■■■■□ 3.57
RERE-210ENST00000468247 ARHGEF11O15085 1522 aa37.27■■■■□ 3.56
RERE-210ENST00000468247 GRIN2BQ13224 1484 aa37.26■■■■□ 3.56
RERE-210ENST00000468247 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.23■■■■□ 3.55
RERE-210ENST00000468247 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
RERE-210ENST00000468247 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.2■■■■□ 3.54
RERE-210ENST00000468247 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.19■■■■□ 3.54
RERE-210ENST00000468247 SYNJ1O43426 1573 aa37.18■■■■□ 3.54
RERE-210ENST00000468247 TOP2BQ02880 1626 aa37.17■■■■□ 3.54
RERE-210ENST00000468247 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.16■■■■□ 3.54
RERE-210ENST00000468247 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.14■■■■□ 3.54
RERE-210ENST00000468247 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
RERE-210ENST00000468247 PBRM1Q86U86 1689 aa37.14■■■■□ 3.54
RERE-210ENST00000468247 SYNJ2O15056 1496 aa37.09■■■■□ 3.53
RERE-210ENST00000468247 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.04■■■■□ 3.52
RERE-210ENST00000468247 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.98■■■■□ 3.51
RERE-210ENST00000468247 ARAP1Q96P48 1450 aa36.96■■■■□ 3.51
RERE-210ENST00000468247 ADAMTS12P58397 1594 aa36.84■■■■□ 3.49
RERE-210ENST00000468247 GRIN2AQ12879 1464 aa36.8■■■■□ 3.48
RERE-210ENST00000468247 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.75■■■■□ 3.47
RERE-210ENST00000468247 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.74■■■■□ 3.47
RERE-210ENST00000468247 CEP170Q5SW79 1584 aa36.68■■■■□ 3.46
RERE-210ENST00000468247 NUP160Q12769 1436 aa36.68■■■■□ 3.46
RERE-210ENST00000468247 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.55■■■■□ 3.44
RERE-210ENST00000468247 SHROOM2Q13796 1616 aa36.45■■■■□ 3.43
RERE-210ENST00000468247 KIF27Q86VH2 1401 aa36.43■■■■□ 3.42
RERE-210ENST00000468247 IGF1RP08069 1367 aa36.43■■■■□ 3.42
RERE-210ENST00000468247 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
RERE-210ENST00000468247 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.31■■■■□ 3.4
RERE-210ENST00000468247 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
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