Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4BQ07343 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4BQ07343 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms