Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGP37231 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGP37231 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGP37231 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGP37231 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGP37231 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGP37231 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGP37231 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGP37231 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGP37231 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGP37231 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGP37231 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms