Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A1P23297 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A1P23297 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms