Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH1P12830 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms