Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C8orf88P0DMB2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms