Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNPO3Q9Y5L0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms