Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM28Q9NW13 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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