Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms