Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-214ENST00000533469 540 ntTSL 49.91□□□□□ -0.823e-8■■■■■ 172
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-212ENST00000529572 1022 ntTSL 58.47□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 172
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 413.75□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 172
UTP3Q9NQZ2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 172
UTP3Q9NQZ2 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 172
UTP3Q9NQZ2 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 172
UTP3Q9NQZ2 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 217.92■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 172
UTP3Q9NQZ2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 171.9
UTP3Q9NQZ2 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 171.9
UTP3Q9NQZ2 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 171.9
UTP3Q9NQZ2 PARVB-205ENST00000444029 742 ntTSL 510.6□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 171.9
UTP3Q9NQZ2 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.216e-9■■■■■ 171.8
UTP3Q9NQZ2 ASPH-223ENST00000522349 531 ntTSL 59.83□□□□□ -0.845e-8■■■■■ 171.8
UTP3Q9NQZ2 ASPH-225ENST00000522835 1258 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.845e-8■■■■■ 171.8
UTP3Q9NQZ2 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.945e-8■■■■■ 171.8
UTP3Q9NQZ2 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.965e-8■■■■■ 171.8
UTP3Q9NQZ2 ASPH-207ENST00000517847 1947 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.995e-8■■■■■ 171.8
UTP3Q9NQZ2 ASPH-212ENST00000518306 755 ntTSL 58.52□□□□□ -1.055e-8■■■■■ 171.8
UTP3Q9NQZ2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.599e-8■■■■■ 171.8
UTP3Q9NQZ2 NADSYN1-204ENST00000525200 3616 ntTSL 210.6□□□□□ -0.719e-8■■■■■ 171.8
UTP3Q9NQZ2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.935e-9■■■■■ 171.7
UTP3Q9NQZ2 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.095e-9■■■■■ 171.7
UTP3Q9NQZ2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 171.7
UTP3Q9NQZ2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 171.5
UTP3Q9NQZ2 KIAA0319L-203ENST00000426982 3213 ntTSL 513.54□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 171.5
UTP3Q9NQZ2 KIAA0319L-217ENST00000485551 4398 ntTSL 27.74□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 171.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.265e-9■■■■■ 171.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.065e-9■■■■■ 171.5
UTP3Q9NQZ2 PRSS53-203ENST00000492427 1782 ntTSL 320.68■□□□□ 0.99e-9■■■■■ 171.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN2-208ENST00000581645 1477 ntTSL 520.62■□□□□ 0.895e-9■■■■■ 171.5
UTP3Q9NQZ2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.699e-9■■■■■ 171.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.615e-9■■■■■ 171.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN2-205ENST00000579856 952 ntTSL 518.82■□□□□ 0.65e-9■■■■■ 171.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN2-211ENST00000583090 683 ntTSL 316.69■□□□□ 0.265e-9■■■■■ 171.5
UTP3Q9NQZ2 ARGLU1-204ENST00000472226 1336 ntTSL 29.32□□□□□ -0.929e-9■■■■■ 171.5
UTP3Q9NQZ2 WNK4-205ENST00000592072 1613 ntTSL 222.62■■□□□ 1.213e-32■■■■■ 171.4
UTP3Q9NQZ2 WNK4-202ENST00000587705 586 ntTSL 419.02■□□□□ 0.643e-32■■■■■ 171.4
UTP3Q9NQZ2 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 171.4
UTP3Q9NQZ2 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -16e-7■■■■■ 171.4
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.925e-8■■■■■ 171.4
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 171.4
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.245e-8■■■■■ 171.4
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.495e-8■■■■■ 171.4
UTP3Q9NQZ2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.292e-7■■■■■ 171.3
UTP3Q9NQZ2 SERTAD3-202ENST00000392028 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 171.3
UTP3Q9NQZ2 HDAC5-210ENST00000591714 667 ntTSL 317.87■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 171.3
UTP3Q9NQZ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.025e-9■■■■■ 171.2
UTP3Q9NQZ2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.975e-9■■■■■ 171.2
UTP3Q9NQZ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.865e-9■■■■■ 171.2
UTP3Q9NQZ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.665e-9■■■■■ 171.2
UTP3Q9NQZ2 FKBP1A-209ENST00000612074 409 ntTSL 213.4□□□□□ -0.265e-9■■■■■ 171.2
UTP3Q9NQZ2 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.335e-9■■■■■ 171.2
UTP3Q9NQZ2 FKBP1A-202ENST00000381719 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.685e-9■■■■■ 171.2
UTP3Q9NQZ2 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.135e-9■■■■■ 171.2
UTP3Q9NQZ2 LDLR-210ENST00000559340 605 ntTSL 59.85□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 171.1
UTP3Q9NQZ2 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 171.1
UTP3Q9NQZ2 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 171.1
UTP3Q9NQZ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.878e-7■■■■■ 171
UTP3Q9NQZ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.658e-7■■■■■ 171
UTP3Q9NQZ2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.078e-7■■■■■ 171
UTP3Q9NQZ2 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.141e-10■■■■■ 171
UTP3Q9NQZ2 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-10■■■■■ 171
UTP3Q9NQZ2 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.041e-10■■■■■ 171
UTP3Q9NQZ2 FANCC-204ENST00000433829 591 ntTSL 38.36□□□□□ -1.071e-10■■■■■ 171
UTP3Q9NQZ2 FANCC-207ENST00000474949 841 ntTSL 57□□□□□ -1.291e-10■■■■■ 171
UTP3Q9NQZ2 FANCC-212ENST00000636777 652 ntTSL 54.37□□□□□ -1.711e-10■■■■■ 171
UTP3Q9NQZ2 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 171
UTP3Q9NQZ2 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 171
UTP3Q9NQZ2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 170.9
UTP3Q9NQZ2 UIMC1-202ENST00000417486 1248 ntTSL 214.27□□□□□ -0.138e-16■■■■■ 170.8
UTP3Q9NQZ2 FANCA-208ENST00000561722 696 ntTSL 313.36□□□□□ -0.278e-16■■■■■ 170.8
UTP3Q9NQZ2 FANCA-209ENST00000562424 745 ntTSL 212.23□□□□□ -0.458e-16■■■■■ 170.8
UTP3Q9NQZ2 TTC33-202ENST00000503936 1707 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 170.8
UTP3Q9NQZ2 RIOK3-206ENST00000581339 888 ntTSL 210.34□□□□□ -0.758e-16■■■■■ 170.8
UTP3Q9NQZ2 TTC33-201ENST00000337702 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.93e-7■■■■■ 170.8
UTP3Q9NQZ2 TTC33-205ENST00000636106 2252 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 170.8
UTP3Q9NQZ2 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 170.8
UTP3Q9NQZ2 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 170.8
UTP3Q9NQZ2 RIOK3-209ENST00000584130 591 ntTSL 48.52□□□□□ -1.058e-16■■■■■ 170.8
UTP3Q9NQZ2 TTC33-204ENST00000511730 784 ntTSL 28.34□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 170.8
UTP3Q9NQZ2 TTC33-203ENST00000504251 1046 ntTSL 28.19□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 170.8
UTP3Q9NQZ2 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 170.7
UTP3Q9NQZ2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.919e-7■■■■■ 170.7
UTP3Q9NQZ2 CPZ-209ENST00000515606 2464 ntTSL 1 (best)19.98■□□□□ 0.799e-7■■■■■ 170.7
UTP3Q9NQZ2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.69e-7■■■■■ 170.7
UTP3Q9NQZ2 GPR78-207ENST00000514302 4944 ntTSL 216.18■□□□□ 0.189e-7■■■■■ 170.7
UTP3Q9NQZ2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 170.7
UTP3Q9NQZ2 NBPF11-203ENST00000614506 5152 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 170.7
UTP3Q9NQZ2 NBPF11-201ENST00000613531 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.66□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 170.7
UTP3Q9NQZ2 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 170.7
UTP3Q9NQZ2 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 170.7
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 517.2■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 170.7
UTP3Q9NQZ2 AMBRA1-210ENST00000531542 561 ntTSL 314.05□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 170.6
UTP3Q9NQZ2 RB1CC1-206ENST00000518710 711 ntTSL 327.61■■■□□ 2.015e-9■■■■■ 170.6
UTP3Q9NQZ2 RB1CC1-203ENST00000517963 551 ntTSL 418.92■□□□□ 0.625e-9■■■■■ 170.6
UTP3Q9NQZ2 RB1CC1-204ENST00000518211 891 ntTSL 518.9■□□□□ 0.625e-9■■■■■ 170.6
UTP3Q9NQZ2 RB1CC1-205ENST00000518468 507 ntTSL 36.66□□□□□ -1.345e-9■■■■■ 170.6
UTP3Q9NQZ2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 170.4
UTP3Q9NQZ2 HDAC5-205ENST00000587135 504 ntTSL 220.75■□□□□ 0.913e-9■■■■■ 170.3
UTP3Q9NQZ2 HDAC5-209ENST00000588703 445 ntTSL 319.19■□□□□ 0.663e-9■■■■■ 170.3
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