Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms