Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF550Q7Z398 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms