Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms