Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms