Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF4Q2M2E3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms