Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q1T7F1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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