Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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