Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IKZF1Q13422 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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