Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms