Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms