Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLUP10909 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLUP10909 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLUP10909 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLUP10909 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLUP10909 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLUP10909 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLUP10909 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLUP10909 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLUP10909 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLUP10909 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLUP10909 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLUP10909 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLUP10909 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms