Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEFMP07197 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms