Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TXNDC9O14530 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC9O14530 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC9O14530 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC9O14530 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC9O14530 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC9O14530 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC9O14530 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC9O14530 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC9O14530 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC9O14530 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC9O14530 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC9O14530 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC9O14530 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms