Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf98E9PRG8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf98E9PRG8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms