Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM5B3KS81 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms