Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IGSF9BQ9UPX0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms