Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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