Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF275Q9NSD4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms