Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf72Q96LT7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf72Q96LT7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms