Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SAMD8Q96LT4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SAMD8Q96LT4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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