Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms