Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms