Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HFEQ30201 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HFEQ30201 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HFEQ30201 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HFEQ30201 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HFEQ30201 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HFEQ30201 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HFEQ30201 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HFEQ30201 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HFEQ30201 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HFEQ30201 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HFEQ30201 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms