Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIP4Q15650 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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