Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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SEC23BQ15437 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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SEC23BQ15437 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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