Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CAMSAP2Q08AD1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMSAP2Q08AD1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms