Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB1Q02818 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms