Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms