Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms